Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
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