Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NECTIN1Q15223 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
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