Protein–RNA interactions for Protein: Q14684

RRP1B, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 758 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1BQ14684 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RRP1BQ14684 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RRP1BQ14684 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RRP1BQ14684 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RRP1BQ14684 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RRP1BQ14684 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RRP1BQ14684 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RRP1BQ14684 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RRP1BQ14684 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RRP1BQ14684 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RRP1BQ14684 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RRP1BQ14684 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RRP1BQ14684 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RRP1BQ14684 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RRP1BQ14684 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RRP1BQ14684 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RRP1BQ14684 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RRP1BQ14684 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RRP1BQ14684 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RRP1BQ14684 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RRP1BQ14684 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RRP1BQ14684 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RRP1BQ14684 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RRP1BQ14684 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRP1BQ14684 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRP1BQ14684 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRP1BQ14684 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRP1BQ14684 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRP1BQ14684 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRP1BQ14684 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRP1BQ14684 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRP1BQ14684 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRP1BQ14684 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRP1BQ14684 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRP1BQ14684 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRP1BQ14684 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRP1BQ14684 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRP1BQ14684 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRP1BQ14684 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRP1BQ14684 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRP1BQ14684 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRP1BQ14684 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRP1BQ14684 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRP1BQ14684 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRP1BQ14684 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRP1BQ14684 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRP1BQ14684 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRP1BQ14684 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRP1BQ14684 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRP1BQ14684 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRP1BQ14684 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRP1BQ14684 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRP1BQ14684 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRP1BQ14684 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRP1BQ14684 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms