Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
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