Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
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