Protein–RNA interactions for Protein: Q13480

GAB1, GRB2-associated-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAB1Q13480 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GAB1Q13480 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GAB1Q13480 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GAB1Q13480 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GAB1Q13480 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GAB1Q13480 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GAB1Q13480 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GAB1Q13480 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GAB1Q13480 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GAB1Q13480 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms