Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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