Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PDE3BQ13370 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PDE3BQ13370 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PDE3BQ13370 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
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