Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
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