Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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