Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLF1Q13351 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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