Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RIGQ13278 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RIGQ13278 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RIGQ13278 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RIGQ13278 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RIGQ13278 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RIGQ13278 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RIGQ13278 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RIGQ13278 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RIGQ13278 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RIGQ13278 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RIGQ13278 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RIGQ13278 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RIGQ13278 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RIGQ13278 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RIGQ13278 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
RIGQ13278 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RIGQ13278 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RIGQ13278 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RIGQ13278 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RIGQ13278 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
RIGQ13278 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RIGQ13278 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RIGQ13278 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RIGQ13278 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RIGQ13278 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RIGQ13278 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RIGQ13278 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RIGQ13278 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
RIGQ13278 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
RIGQ13278 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
RIGQ13278 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
RIGQ13278 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
RIGQ13278 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
RIGQ13278 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
RIGQ13278 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
RIGQ13278 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RIGQ13278 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RIGQ13278 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RIGQ13278 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RIGQ13278 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RIGQ13278 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RIGQ13278 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RIGQ13278 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RIGQ13278 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RIGQ13278 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RIGQ13278 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RIGQ13278 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RIGQ13278 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RIGQ13278 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RIGQ13278 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RIGQ13278 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RIGQ13278 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
RIGQ13278 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RIGQ13278 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
RIGQ13278 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
RIGQ13278 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RIGQ13278 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RIGQ13278 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RIGQ13278 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RIGQ13278 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RIGQ13278 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RIGQ13278 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RIGQ13278 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RIGQ13278 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RIGQ13278 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RIGQ13278 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
RIGQ13278 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RIGQ13278 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RIGQ13278 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
RIGQ13278 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RIGQ13278 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RIGQ13278 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RIGQ13278 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RIGQ13278 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RIGQ13278 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RIGQ13278 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RIGQ13278 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RIGQ13278 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RIGQ13278 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RIGQ13278 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RIGQ13278 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RIGQ13278 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RIGQ13278 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RIGQ13278 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RIGQ13278 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RIGQ13278 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RIGQ13278 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RIGQ13278 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RIGQ13278 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RIGQ13278 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
RIGQ13278 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RIGQ13278 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
RIGQ13278 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
RIGQ13278 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RIGQ13278 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RIGQ13278 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RIGQ13278 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RIGQ13278 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RIGQ13278 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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