Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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