Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
STRN3Q13033 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
STRN3Q13033 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
STRN3Q13033 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
STRN3Q13033 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
STRN3Q13033 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
STRN3Q13033 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
STRN3Q13033 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
STRN3Q13033 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
STRN3Q13033 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
STRN3Q13033 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
STRN3Q13033 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
STRN3Q13033 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
STRN3Q13033 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
STRN3Q13033 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
STRN3Q13033 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
STRN3Q13033 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
STRN3Q13033 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
STRN3Q13033 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
STRN3Q13033 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
STRN3Q13033 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
STRN3Q13033 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
STRN3Q13033 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
STRN3Q13033 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
STRN3Q13033 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.32■■□□□ 1
STRN3Q13033 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
STRN3Q13033 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
STRN3Q13033 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
STRN3Q13033 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
STRN3Q13033 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
STRN3Q13033 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
STRN3Q13033 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
STRN3Q13033 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
STRN3Q13033 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
STRN3Q13033 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
STRN3Q13033 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
STRN3Q13033 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
STRN3Q13033 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STRN3Q13033 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STRN3Q13033 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STRN3Q13033 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STRN3Q13033 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
STRN3Q13033 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
STRN3Q13033 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.31■■□□□ 1
STRN3Q13033 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STRN3Q13033 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
STRN3Q13033 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.31■■□□□ 1
STRN3Q13033 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
STRN3Q13033 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STRN3Q13033 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STRN3Q13033 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
STRN3Q13033 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STRN3Q13033 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STRN3Q13033 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
STRN3Q13033 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STRN3Q13033 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STRN3Q13033 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STRN3Q13033 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.3■■□□□ 1
STRN3Q13033 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
STRN3Q13033 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STRN3Q13033 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STRN3Q13033 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STRN3Q13033 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STRN3Q13033 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STRN3Q13033 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
STRN3Q13033 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STRN3Q13033 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
STRN3Q13033 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
STRN3Q13033 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STRN3Q13033 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
STRN3Q13033 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.3■■□□□ 1
STRN3Q13033 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.3■■□□□ 1
STRN3Q13033 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
STRN3Q13033 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.3■■□□□ 1
STRN3Q13033 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
STRN3Q13033 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.3■■□□□ 1
STRN3Q13033 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
STRN3Q13033 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STRN3Q13033 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.3■■□□□ 1
STRN3Q13033 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STRN3Q13033 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STRN3Q13033 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STRN3Q13033 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.29■■□□□ 1
STRN3Q13033 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STRN3Q13033 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
STRN3Q13033 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STRN3Q13033 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
STRN3Q13033 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
STRN3Q13033 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
STRN3Q13033 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
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