Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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