Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms