Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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PTPN13Q12923 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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PTPN13Q12923 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN13Q12923 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
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