Protein–RNA interactions for Protein: Q12912

LRMP, Lymphoid-restricted membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRMPQ12912 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRMPQ12912 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms