Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC173Q0VFZ6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms