Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CGNL1Q0VF96 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms