Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOBRQ0VD83 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms