Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC15Q0P6D6 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms