Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KCNA1Q09470 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KCNA1Q09470 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNA1Q09470 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KCNA1Q09470 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNA1Q09470 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
KCNA1Q09470 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNA1Q09470 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KCNA1Q09470 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KCNA1Q09470 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KCNA1Q09470 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNA1Q09470 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KCNA1Q09470 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNA1Q09470 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNA1Q09470 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KCNA1Q09470 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KCNA1Q09470 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNA1Q09470 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNA1Q09470 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNA1Q09470 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNA1Q09470 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNA1Q09470 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNA1Q09470 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNA1Q09470 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNA1Q09470 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNA1Q09470 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNA1Q09470 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNA1Q09470 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNA1Q09470 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNA1Q09470 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNA1Q09470 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNA1Q09470 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNA1Q09470 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNA1Q09470 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNA1Q09470 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNA1Q09470 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNA1Q09470 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNA1Q09470 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNA1Q09470 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNA1Q09470 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNA1Q09470 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNA1Q09470 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNA1Q09470 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNA1Q09470 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNA1Q09470 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNA1Q09470 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNA1Q09470 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNA1Q09470 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNA1Q09470 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNA1Q09470 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNA1Q09470 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNA1Q09470 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNA1Q09470 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNA1Q09470 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNA1Q09470 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNA1Q09470 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNA1Q09470 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNA1Q09470 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNA1Q09470 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNA1Q09470 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNA1Q09470 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNA1Q09470 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNA1Q09470 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNA1Q09470 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNA1Q09470 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNA1Q09470 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNA1Q09470 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNA1Q09470 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNA1Q09470 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNA1Q09470 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNA1Q09470 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNA1Q09470 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNA1Q09470 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNA1Q09470 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNA1Q09470 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNA1Q09470 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNA1Q09470 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNA1Q09470 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNA1Q09470 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNA1Q09470 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNA1Q09470 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNA1Q09470 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNA1Q09470 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNA1Q09470 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNA1Q09470 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNA1Q09470 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNA1Q09470 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNA1Q09470 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNA1Q09470 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNA1Q09470 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KCNA1Q09470 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KCNA1Q09470 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNA1Q09470 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNA1Q09470 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNA1Q09470 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNA1Q09470 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNA1Q09470 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNA1Q09470 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNA1Q09470 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNA1Q09470 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms