Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH1

ACSM1, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM1Q08AH1 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACSM1Q08AH1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACSM1Q08AH1 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACSM1Q08AH1 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACSM1Q08AH1 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACSM1Q08AH1 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACSM1Q08AH1 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACSM1Q08AH1 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACSM1Q08AH1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACSM1Q08AH1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACSM1Q08AH1 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACSM1Q08AH1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACSM1Q08AH1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACSM1Q08AH1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACSM1Q08AH1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACSM1Q08AH1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACSM1Q08AH1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACSM1Q08AH1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACSM1Q08AH1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACSM1Q08AH1 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACSM1Q08AH1 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACSM1Q08AH1 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACSM1Q08AH1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ACSM1Q08AH1 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ACSM1Q08AH1 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACSM1Q08AH1 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACSM1Q08AH1 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACSM1Q08AH1 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACSM1Q08AH1 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACSM1Q08AH1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACSM1Q08AH1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACSM1Q08AH1 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACSM1Q08AH1 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACSM1Q08AH1 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACSM1Q08AH1 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACSM1Q08AH1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACSM1Q08AH1 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACSM1Q08AH1 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACSM1Q08AH1 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACSM1Q08AH1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACSM1Q08AH1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACSM1Q08AH1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ACSM1Q08AH1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACSM1Q08AH1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACSM1Q08AH1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACSM1Q08AH1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ACSM1Q08AH1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACSM1Q08AH1 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACSM1Q08AH1 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACSM1Q08AH1 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACSM1Q08AH1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACSM1Q08AH1 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACSM1Q08AH1 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACSM1Q08AH1 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACSM1Q08AH1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACSM1Q08AH1 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACSM1Q08AH1 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACSM1Q08AH1 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACSM1Q08AH1 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACSM1Q08AH1 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACSM1Q08AH1 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACSM1Q08AH1 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACSM1Q08AH1 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACSM1Q08AH1 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACSM1Q08AH1 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ACSM1Q08AH1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACSM1Q08AH1 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACSM1Q08AH1 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ACSM1Q08AH1 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACSM1Q08AH1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACSM1Q08AH1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACSM1Q08AH1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACSM1Q08AH1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACSM1Q08AH1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACSM1Q08AH1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ACSM1Q08AH1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACSM1Q08AH1 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACSM1Q08AH1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACSM1Q08AH1 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACSM1Q08AH1 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACSM1Q08AH1 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACSM1Q08AH1 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACSM1Q08AH1 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ACSM1Q08AH1 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACSM1Q08AH1 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACSM1Q08AH1 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACSM1Q08AH1 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACSM1Q08AH1 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ACSM1Q08AH1 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACSM1Q08AH1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACSM1Q08AH1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACSM1Q08AH1 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACSM1Q08AH1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACSM1Q08AH1 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACSM1Q08AH1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACSM1Q08AH1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACSM1Q08AH1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACSM1Q08AH1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACSM1Q08AH1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ACSM1Q08AH1 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms