Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms