Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms