Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms