Protein–RNA interactions for Protein: Q06033

ITIH3, Inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H3, humanhuman

Predictions only

Length 890 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITIH3Q06033 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
ITIH3Q06033 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ITIH3Q06033 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITIH3Q06033 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ITIH3Q06033 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
ITIH3Q06033 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ITIH3Q06033 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITIH3Q06033 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITIH3Q06033 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ITIH3Q06033 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITIH3Q06033 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITIH3Q06033 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITIH3Q06033 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITIH3Q06033 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITIH3Q06033 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITIH3Q06033 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ITIH3Q06033 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITIH3Q06033 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ITIH3Q06033 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITIH3Q06033 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITIH3Q06033 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITIH3Q06033 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ITIH3Q06033 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ITIH3Q06033 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ITIH3Q06033 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITIH3Q06033 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITIH3Q06033 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITIH3Q06033 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITIH3Q06033 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ITIH3Q06033 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITIH3Q06033 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITIH3Q06033 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ITIH3Q06033 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ITIH3Q06033 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ITIH3Q06033 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITIH3Q06033 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITIH3Q06033 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITIH3Q06033 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITIH3Q06033 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ITIH3Q06033 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ITIH3Q06033 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ITIH3Q06033 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ITIH3Q06033 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITIH3Q06033 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITIH3Q06033 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITIH3Q06033 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITIH3Q06033 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITIH3Q06033 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITIH3Q06033 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITIH3Q06033 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITIH3Q06033 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITIH3Q06033 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ITIH3Q06033 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ITIH3Q06033 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ITIH3Q06033 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ITIH3Q06033 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ITIH3Q06033 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ITIH3Q06033 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITIH3Q06033 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ITIH3Q06033 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ITIH3Q06033 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITIH3Q06033 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITIH3Q06033 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITIH3Q06033 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITIH3Q06033 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITIH3Q06033 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITIH3Q06033 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ITIH3Q06033 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITIH3Q06033 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITIH3Q06033 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITIH3Q06033 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITIH3Q06033 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ITIH3Q06033 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ITIH3Q06033 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ITIH3Q06033 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ITIH3Q06033 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ITIH3Q06033 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ITIH3Q06033 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ITIH3Q06033 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITIH3Q06033 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITIH3Q06033 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
ITIH3Q06033 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ITIH3Q06033 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITIH3Q06033 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITIH3Q06033 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITIH3Q06033 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITIH3Q06033 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITIH3Q06033 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITIH3Q06033 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITIH3Q06033 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITIH3Q06033 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITIH3Q06033 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITIH3Q06033 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITIH3Q06033 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITIH3Q06033 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITIH3Q06033 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITIH3Q06033 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITIH3Q06033 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITIH3Q06033 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITIH3Q06033 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms