Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CTDSPL2Q05D32 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms