Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms