Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms