Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PPARDQ03181 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PPARDQ03181 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PPARDQ03181 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PPARDQ03181 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PPARDQ03181 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms