Protein–RNA interactions for Protein: Q02978

SLC25A11, Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A11Q02978 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC25A11Q02978 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms