Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 LINC02318-201ENST00000553785 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 HMGB1P8-201ENST00000558211 949 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 AC007228.2-201ENST00000602145 1328 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 FAM122C-202ENST00000370785 1344 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 AC018953.1-201ENST00000523265 730 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 AC080011.1-201ENST00000552378 989 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 TCEANC-205ENST00000544987 1146 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 AP005264.6-201ENST00000592801 414 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 AC016252.1-201ENST00000609721 474 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CACNB1Q02641 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNB1Q02641 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms