Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF8Q02556 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF8Q02556 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF8Q02556 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF8Q02556 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF8Q02556 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF8Q02556 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF8Q02556 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF8Q02556 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF8Q02556 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF8Q02556 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF8Q02556 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF8Q02556 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF8Q02556 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF8Q02556 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF8Q02556 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF8Q02556 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF8Q02556 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF8Q02556 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF8Q02556 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF8Q02556 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms