Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms