Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms