Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPTBN1Q01082 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms