Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLTCQ00610 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLTCQ00610 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLTCQ00610 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLTCQ00610 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CLTCQ00610 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLTCQ00610 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLTCQ00610 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLTCQ00610 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLTCQ00610 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLTCQ00610 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLTCQ00610 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLTCQ00610 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CLTCQ00610 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLTCQ00610 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLTCQ00610 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLTCQ00610 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLTCQ00610 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLTCQ00610 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CLTCQ00610 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLTCQ00610 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLTCQ00610 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLTCQ00610 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLTCQ00610 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLTCQ00610 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLTCQ00610 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLTCQ00610 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLTCQ00610 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLTCQ00610 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLTCQ00610 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLTCQ00610 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLTCQ00610 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLTCQ00610 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLTCQ00610 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CLTCQ00610 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLTCQ00610 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLTCQ00610 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLTCQ00610 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLTCQ00610 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CLTCQ00610 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLTCQ00610 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLTCQ00610 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLTCQ00610 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLTCQ00610 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLTCQ00610 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CLTCQ00610 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CLTCQ00610 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms