Protein–RNA interactions for Protein: Q00341

HDLBP, Vigilin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBPQ00341 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDLBPQ00341 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms