Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FGD1P98174 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FGD1P98174 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FGD1P98174 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FGD1P98174 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FGD1P98174 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FGD1P98174 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FGD1P98174 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FGD1P98174 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FGD1P98174 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FGD1P98174 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FGD1P98174 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FGD1P98174 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FGD1P98174 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FGD1P98174 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
FGD1P98174 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FGD1P98174 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FGD1P98174 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FGD1P98174 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FGD1P98174 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FGD1P98174 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FGD1P98174 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FGD1P98174 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FGD1P98174 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FGD1P98174 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FGD1P98174 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FGD1P98174 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FGD1P98174 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGD1P98174 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGD1P98174 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGD1P98174 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGD1P98174 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGD1P98174 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGD1P98174 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGD1P98174 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGD1P98174 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGD1P98174 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGD1P98174 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGD1P98174 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGD1P98174 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGD1P98174 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGD1P98174 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGD1P98174 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGD1P98174 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGD1P98174 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGD1P98174 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGD1P98174 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGD1P98174 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGD1P98174 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGD1P98174 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGD1P98174 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGD1P98174 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGD1P98174 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGD1P98174 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGD1P98174 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGD1P98174 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGD1P98174 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGD1P98174 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGD1P98174 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGD1P98174 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGD1P98174 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGD1P98174 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGD1P98174 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGD1P98174 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGD1P98174 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGD1P98174 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGD1P98174 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGD1P98174 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGD1P98174 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGD1P98174 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGD1P98174 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGD1P98174 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGD1P98174 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGD1P98174 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGD1P98174 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FGD1P98174 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGD1P98174 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGD1P98174 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGD1P98174 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGD1P98174 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGD1P98174 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGD1P98174 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGD1P98174 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGD1P98174 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGD1P98174 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGD1P98174 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGD1P98174 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGD1P98174 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGD1P98174 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGD1P98174 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGD1P98174 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGD1P98174 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGD1P98174 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGD1P98174 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGD1P98174 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGD1P98174 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGD1P98174 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGD1P98174 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGD1P98174 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGD1P98174 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms