Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms