Protein–RNA interactions for Protein: P78539

SRPX, Sushi repeat-containing protein SRPX, humanhuman

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPXP78539 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRPXP78539 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRPXP78539 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRPXP78539 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRPXP78539 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRPXP78539 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRPXP78539 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRPXP78539 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRPXP78539 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRPXP78539 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRPXP78539 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRPXP78539 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRPXP78539 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRPXP78539 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRPXP78539 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRPXP78539 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRPXP78539 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRPXP78539 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRPXP78539 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRPXP78539 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRPXP78539 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRPXP78539 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRPXP78539 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRPXP78539 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRPXP78539 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SRPXP78539 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRPXP78539 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRPXP78539 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRPXP78539 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRPXP78539 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRPXP78539 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SRPXP78539 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRPXP78539 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRPXP78539 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRPXP78539 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRPXP78539 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRPXP78539 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRPXP78539 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRPXP78539 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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SRPXP78539 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRPXP78539 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRPXP78539 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRPXP78539 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRPXP78539 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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SRPXP78539 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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SRPXP78539 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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SRPXP78539 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRPXP78539 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRPXP78539 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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SRPXP78539 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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SRPXP78539 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRPXP78539 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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SRPXP78539 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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SRPXP78539 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRPXP78539 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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SRPXP78539 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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SRPXP78539 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRPXP78539 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRPXP78539 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRPXP78539 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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SRPXP78539 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRPXP78539 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRPXP78539 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRPXP78539 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRPXP78539 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRPXP78539 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRPXP78539 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRPXP78539 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRPXP78539 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRPXP78539 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRPXP78539 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRPXP78539 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRPXP78539 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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