Protein–RNA interactions for Protein: P60510

PPP4C, Serine/threonine-protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4CP60510 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP4CP60510 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP4CP60510 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms