Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXL3P58215 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms