Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIPK4P57078 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIPK4P57078 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIPK4P57078 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIPK4P57078 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIPK4P57078 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIPK4P57078 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIPK4P57078 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIPK4P57078 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIPK4P57078 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIPK4P57078 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RIPK4P57078 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIPK4P57078 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIPK4P57078 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIPK4P57078 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIPK4P57078 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIPK4P57078 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIPK4P57078 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIPK4P57078 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIPK4P57078 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIPK4P57078 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIPK4P57078 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIPK4P57078 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIPK4P57078 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIPK4P57078 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIPK4P57078 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RIPK4P57078 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIPK4P57078 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIPK4P57078 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIPK4P57078 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIPK4P57078 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RIPK4P57078 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIPK4P57078 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIPK4P57078 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIPK4P57078 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIPK4P57078 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIPK4P57078 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIPK4P57078 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RIPK4P57078 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RIPK4P57078 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIPK4P57078 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIPK4P57078 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIPK4P57078 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIPK4P57078 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIPK4P57078 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RIPK4P57078 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIPK4P57078 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIPK4P57078 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIPK4P57078 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIPK4P57078 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIPK4P57078 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIPK4P57078 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIPK4P57078 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIPK4P57078 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIPK4P57078 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RIPK4P57078 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RIPK4P57078 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RIPK4P57078 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RIPK4P57078 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RIPK4P57078 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RIPK4P57078 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RIPK4P57078 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RIPK4P57078 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RIPK4P57078 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RIPK4P57078 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RIPK4P57078 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIPK4P57078 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIPK4P57078 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIPK4P57078 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIPK4P57078 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIPK4P57078 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIPK4P57078 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIPK4P57078 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIPK4P57078 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIPK4P57078 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIPK4P57078 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIPK4P57078 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RIPK4P57078 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RIPK4P57078 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RIPK4P57078 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RIPK4P57078 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RIPK4P57078 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RIPK4P57078 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RIPK4P57078 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RIPK4P57078 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RIPK4P57078 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RIPK4P57078 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RIPK4P57078 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RIPK4P57078 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RIPK4P57078 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RIPK4P57078 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RIPK4P57078 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RIPK4P57078 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RIPK4P57078 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RIPK4P57078 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RIPK4P57078 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RIPK4P57078 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RIPK4P57078 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RIPK4P57078 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RIPK4P57078 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms