Protein–RNA interactions for Protein: P56278

MTCP1, Protein p13 MTCP-1, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTCP1P56278 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MTCP1P56278 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms