Protein–RNA interactions for Protein: P55771

PAX9, Paired box protein Pax-9, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX9P55771 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PAX9P55771 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAX9P55771 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAX9P55771 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAX9P55771 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAX9P55771 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAX9P55771 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAX9P55771 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAX9P55771 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAX9P55771 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAX9P55771 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAX9P55771 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAX9P55771 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAX9P55771 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAX9P55771 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAX9P55771 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAX9P55771 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAX9P55771 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAX9P55771 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAX9P55771 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAX9P55771 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAX9P55771 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAX9P55771 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAX9P55771 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAX9P55771 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAX9P55771 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAX9P55771 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAX9P55771 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAX9P55771 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAX9P55771 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAX9P55771 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAX9P55771 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAX9P55771 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAX9P55771 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAX9P55771 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAX9P55771 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAX9P55771 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAX9P55771 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAX9P55771 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAX9P55771 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAX9P55771 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAX9P55771 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAX9P55771 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAX9P55771 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAX9P55771 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAX9P55771 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAX9P55771 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAX9P55771 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PAX9P55771 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAX9P55771 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAX9P55771 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAX9P55771 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAX9P55771 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAX9P55771 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAX9P55771 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAX9P55771 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAX9P55771 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAX9P55771 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAX9P55771 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAX9P55771 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAX9P55771 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAX9P55771 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAX9P55771 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PAX9P55771 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAX9P55771 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAX9P55771 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAX9P55771 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAX9P55771 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAX9P55771 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAX9P55771 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAX9P55771 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAX9P55771 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAX9P55771 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PAX9P55771 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAX9P55771 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAX9P55771 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAX9P55771 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAX9P55771 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAX9P55771 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAX9P55771 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAX9P55771 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAX9P55771 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAX9P55771 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAX9P55771 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAX9P55771 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAX9P55771 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAX9P55771 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAX9P55771 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAX9P55771 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAX9P55771 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAX9P55771 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAX9P55771 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAX9P55771 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAX9P55771 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAX9P55771 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAX9P55771 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAX9P55771 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAX9P55771 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAX9P55771 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAX9P55771 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms