Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP9P55211 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP9P55211 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP9P55211 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP9P55211 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP9P55211 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP9P55211 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP9P55211 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP9P55211 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP9P55211 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP9P55211 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP9P55211 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP9P55211 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP9P55211 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP9P55211 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP9P55211 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP9P55211 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP9P55211 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP9P55211 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP9P55211 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP9P55211 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP9P55211 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP9P55211 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP9P55211 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP9P55211 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP9P55211 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP9P55211 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP9P55211 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP9P55211 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP9P55211 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP9P55211 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP9P55211 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP9P55211 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP9P55211 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP9P55211 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP9P55211 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP9P55211 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP9P55211 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP9P55211 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP9P55211 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP9P55211 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP9P55211 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP9P55211 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP9P55211 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASP9P55211 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASP9P55211 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASP9P55211 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASP9P55211 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASP9P55211 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASP9P55211 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASP9P55211 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASP9P55211 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASP9P55211 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASP9P55211 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASP9P55211 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASP9P55211 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASP9P55211 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASP9P55211 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASP9P55211 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASP9P55211 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASP9P55211 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASP9P55211 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CASP9P55211 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CASP9P55211 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASP9P55211 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASP9P55211 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASP9P55211 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASP9P55211 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASP9P55211 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASP9P55211 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CASP9P55211 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CASP9P55211 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CASP9P55211 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CASP9P55211 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CASP9P55211 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CASP9P55211 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CASP9P55211 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CASP9P55211 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP9P55211 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP9P55211 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP9P55211 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP9P55211 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP9P55211 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP9P55211 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP9P55211 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP9P55211 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP9P55211 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP9P55211 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP9P55211 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP9P55211 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP9P55211 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP9P55211 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP9P55211 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP9P55211 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP9P55211 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP9P55211 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP9P55211 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP9P55211 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP9P55211 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP9P55211 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms