Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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PGGT1BP53609 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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PGGT1BP53609 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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PGGT1BP53609 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
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PGGT1BP53609 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
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PGGT1BP53609 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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PGGT1BP53609 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PGGT1BP53609 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
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